一、氣相色譜儀進樣口硅膠墊的影響
①進樣針頭質量不好，邊緣不夠平整，硅膠墊容易損壞。
②硅膠墊使用次數過多或時間長老化，硅膠墊質量不好，材料彈性差，硅膠墊碎屑進入汽化室。
③硅膠墊被污染，如進樣時針頭處附著的樣品液滴被硅膠隔墊所吸附，在之后的分析過程中一點點脫附后進入色譜柱中。
二、進樣口、檢測器或襯管和分流平板污染
①長時間未進行色譜儀的定期維護；
②汽化室和襯管內經常會聚集一些沉積物及高沸點物質，如果碰到某次分析高沸點物質時，進樣口溫度升高時就會使聚集的物質逸出造成空白值偏高；
③在檢測器中和分流平板的凹槽中未揮發的物質會慢慢積累，造成空白值偏高。
三、色譜柱的影響
①色譜柱未充分老化，柱溫過低老化不充分，溫度過高產生液相遺失。
②色譜柱長時間使用。柱自身有吸附特性，柱內余留高濃度樣品或柱內留存高沸點物質，柱頭被污染。再者毛細管柱低負荷量，需要高靈敏度檢測器，這樣就特別容易造成空白值偏高。
四、試劑污染
試劑在進樣前的處理過程中受到污染或試劑不純。
