一、儀器穩定性差別
國產氣相色譜儀的技術水平已經相當高了，有些產品可以與國外同類產品相媲美，某些性能還處于ling先水平，僅僅是在計算機反控上還少一些。部分國內廠家自產的儀器穩定性不大好，原因在于溫度控制系統,流量控制系統精度不強。進口儀器一般正常使用一年沒有問題。而如果國產儀器仿進口穩定性好的品牌，穩定性也相當不錯。
進口氣相色譜儀也不是什么都好，各家的色譜都存在不同程度的問題，安捷倫和島津色譜在進口色譜中占的比例很大，但他們的儀器也都存在問題，安捷倫的FID檢測器在結構上不太理想，常出現積水、難點火、檢測器基流過大現象。島津色譜在氣路設計上死體積過大。
二、儀器價格、配件價格比較
進口氣相色譜儀一般價格在10萬以上，配置好的可能有幾十萬、上百萬。國產一般配置氣相色譜儀主機一般在四萬至六萬、氦離子檢測器的大概三十萬。儀器維修時配件的價格也是要考慮的因素，進口的配件相對價格要高很多。
進口儀器價格貴，當然質量有保證，很多功能升級，但如果你是企業，分析條件固定，買自動化程度太高的儀器必要性不大，這樣一來許多性能用不到，等于白花錢。固很多高等院校、研發室及企業都用國產氣相色譜儀。
三、售后、培訓比較
一般儀器質保一年，一年后出了問題，色譜操作人員們便頭疼，急忙打售后。進口儀器的價格是國產的幾倍甚至十幾倍，而保修期后的維修費非常高。許多進口儀器一過保修期就來毛病了，因為許多用于自動化控制的精密的零部件到那時就得換了，而且很不方便。國產廠家維修起來性價比相對要好，而且上門維修相對方便。
另外，一般廠商都會組織經銷商、用戶學習儀器相關知識，對色譜儀的操作進行培訓。只是如果廠商就在你單位當地，這樣對你去參加培訓、學習以及購買前去廠家實地考察會更方便。
綜上可以看出，國產、進口儀器沒有誰占有的優勢。那么要選擇國產儀器的話，國產眾多廠家又如何選擇呢？
我國進口主打品牌是惠普(安捷倫)、島津，而國產氣相色譜儀基本是仿日本島津，特點是經濟實惠卻因電路問題容易死機。而安捷倫同等配置儀器差不多要比島津貴一倍(安捷倫原是從惠普公司分出來的公司)，電路系統完善，死機問題很少存在。


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