開機注意事項
要求使用220?V單相交流電。如發生斷電，不管任何原因造成的，首先關閉儀器面板左下角的開關，等待供電恢復10分鐘以上再開啟電源，否則有可能燒毀電路板。儀器運行時需提供純度>99%的氮氣作為噴霧與干燥氣，輸出壓力為0.6～0.7?MPa。實驗開始前先檢查液氮罐液體存量是否充足。儀器開機時，確認電源已經連接而且氣振閥處于關閉，打開儀器總電源，隨后將前面板左下方的電源按鍵按下，真空泵即開始工作。大約2～3分鐘后，儀器內置的系統啟動完畢，可以開啟Mass hunter軟件與儀器通訊。等待四極桿溫度達到100℃，高真空達到4×10-5??Torr之后，即可進行調諧或開始實驗。在儀器開始抽真空時，請不要打開前級泵上的氣振閥，否則可能因為回油污染真空腔體內部。
流動相的要求
每次開機前，保證超純水和流動相的新鮮，泵的各個管路不應余留上次殘留的溶劑。流動相需符合HPLC與LC-MS要求等級，流動相中盡量加易揮發的鹽，盡量不使用表面活性劑之類，否則容易導致離子抑制，表面活性劑產生的加合物和離子簇會干擾質譜數據。如果遇到離子抑制，可以把樣品峰往后推或者改變提取方法，或者考慮用APCI源。盡量不使用無揮發性的緩沖劑，例如，磷酸緩沖劑等，磷酸鹽及其他不揮發緩沖鹽在離子源會沉淀并堵塞毛細管等。另外液質不能承受過大流速。溶劑瓶避免陽光直射。
樣品的要求
保證樣品的清潔，進樣前盡量使用0.22?µm的濾膜濾過，避免樣品太臟而堵塞色譜柱或離子源的毛細管;樣品溶劑必須是色譜純，應該和流動相比例一致;進樣濃度不宜太高，因為太高濃度的樣品容易污染靈敏度高的儀器，進而影響檢驗結果。由于液質的流速較小(ESI一般為0.2?mL/min)，所以配置樣品的溶劑強度不能太大，盡量小于起始比例，否則，會出現保留時間偏移、峰形扭曲等問題。
進樣系統的維護
對于液相色譜來說，無論是手動進樣還是自動進樣，都是使用六通閥進樣的。進樣裝置要求：密封性好，死體積小，重復性好，保證中心進樣，進樣時對色譜系統的壓力、流量影響小樣。六通閥使用及維護注意事項：①樣品溶液進樣前必須用0.45?µm濾膜過濾，以減少微粒對進樣閥的磨損。②轉動閥芯時不能太慢，更不能停留在中間位置，否則流動相受阻，使泵內壓力劇增，甚至超過泵的限值壓力;再轉到進樣位時，過高的壓力將使柱頭損壞。③為防止緩沖鹽和樣品殘留在進樣閥中，每次分析結束后應沖洗進樣閥。通常可用水沖洗，或先用能溶解樣品的溶劑沖洗，再用水沖洗。注意：溶劑入口過濾芯為消耗品，尤其不可以使用超聲清洗，可以使用稀硝酸浸泡，然后用水沖洗至中性，以重復使用。
色譜柱系統的維護
在色譜操作過程中，需要注意下列問題：①色譜柱的選擇會直接影響混合物中組分的分離，所以一定要選用合適的色譜柱，在使用新柱前要在自己的液相色譜儀上進行性能測試，即使用色譜柱附帶的檢驗報告上測試條件和樣品來測定該色譜柱的柱效，并且在以后的使用中，應時常對色譜柱進行測試。②柱子在使用過程中，不能碰撞、彎曲或強烈震動;避免壓力和溫度的急劇變化，機械震動和溫度的突然變化都會影響柱內的填充狀況;柱壓的突然升高或降低也會沖動柱內填料，因此在調節流速時應該緩慢進行。③當柱子和色譜儀聯結時，閥件或管路一定要清洗干凈，樣品前處理對于柱子使用壽命影響甚大，進樣樣品要提純過濾并且嚴格控制進樣量，可以使用保護柱。④注意色譜柱的pH值使用范圍，不能高溫下過長時間使用硅膠鍵和相;每天分析工作結束后，都要用適當的溶劑來清洗柱子。若分析柱長期不使用，應用適當有機溶劑保存并封閉。
